Rotamer

释义 Definition

rotamer（旋转异构体）：指由于单键旋转导致的不同构象（常见于有机分子与蛋白质侧链）；这些构象通常对应能量极小值，因此在结构分析中会以“若干常见取向”来描述。该词在蛋白质结构里常用来指侧链的常见构象（rotamer library 中的条目）。

发音 Pronunciation (IPA)

/ˈroʊtəˌmər/

例句 Examples

The rotamer of this side chain affects how the protein binds the ligand.
这个侧链的旋转异构体会影响蛋白质与配体的结合。

During refinement, the model was corrected using a rotamer library to avoid steric clashes and improve the electron-density fit.
在结构精修过程中，研究者使用旋转异构体库校正模型，以避免位阻冲突并改善与电子密度的吻合。

词源 Etymology

rota- 来自拉丁语 rota（“轮子/旋转”之意的词根联想），**-mer** 来自希腊语 meros（“部分”）。整体意思可理解为“因旋转而产生的（不同）部分/形式”。在现代化学与结构生物学语境中，rotamer 特别常用于描述可旋转键带来的稳定构象集合。

相关词 Related Words

• Conformer
• Conformation
• Torsion
• Dihedral
• Isomer
• Stereoisomer
• Steric
• Backbone

文献与作品 Literary Works

• 《Introduction to Protein Structure》（Branden & Tooze）：在讨论侧链构象与结构分析时常提到 rotamer/rotamer libraries。
• 《Molecular Biology of the Cell》（Alberts 等）：在蛋白质结构与相互作用相关章节中会涉及侧链构象（包括 rotamer 的概念）。
• 《Lehninger Principles of Biochemistry》（Nelson & Cox）：在蛋白质结构与构象章节的相关表述中可能出现 rotamer（尤其在更深入的结构讨论或配套材料中）。
• 《Protein Structure and Function》（Petsko & Ringe）：在结构解析、侧链取向与能量构象讨论中常使用该术语。