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Psiblast

释义 Definition

PSI-BLAST(常写作 PSI-BLAST)是一种用于蛋白质序列相似性搜索的生物信息学工具;它会在初次搜索后根据命中序列构建位置特异性打分矩阵(PSSM),并进行多轮迭代,以更敏感地发现远缘同源序列。

发音 Pronunciation

/ˌpiːˌɛsˌaɪˈblæst/

例句 Examples

I used PSI-BLAST to find similar proteins.
我用 PSI-BLAST 来寻找相似的蛋白质。

After three PSI-BLAST iterations, the profile detected several distant homologs that standard BLAST missed.
经过三轮 PSI-BLAST 迭代后,这个序列特征模型检测到了标准 BLAST 漏掉的多个远缘同源序列。

词源 Etymology

PSI-BLAST 来自 Position-Specific Iterated BLAST 的缩写:

  • Position-Specific(位置特异性):指每个位点使用不同的统计权重(PSSM)
  • Iterated(迭代):指多轮重复搜索并更新模型
  • BLAST:Basic Local Alignment Search Tool(用于局部序列比对与搜索)

相关词 Related Words

文学与著作中的用例 Literary Works

  • Altschul, S. F., et al. “Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs.” Nucleic Acids Research (1997).
  • Mount, D. W. Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis(常在序列搜索章节讨论 PSI-BLAST)。
  • Lesk, A. M. Introduction to Bioinformatics(在同源搜索与序列比对相关章节提及 PSI-BLAST)。
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