我对你说到的现象是不认同的，但是同时我也怀疑“长相”在整个职业生涯中能捞到多少好处。

的确，长得好看是相对容易受到优待，尤其是在初次印象重要的场合，比如商务会谈，或者是生活消费之类的场合。但是在一个稳定的工作环境中，长相不会成为重要因素，随着时间的推移，同事对你的印象会慢慢地从长相转移到你的业务能力上。

因此我觉得你可能没有把故事说全，或者是你还没有意识到哪里出了问题。
不可否认你说的在某些公司都是事实，但我感觉这些问题被夸大了。你自己也提到了你的人缘比较差，但把这个问题完全归结于长相。
从你的描述来看，你个人非常在意长相，甚至有可能你比那些你认为”以貌取人“的同事更加在意自己的长相，以至于在积极探讨自己受到的不公是否是因为长相的原因。

我可以基本肯定的告诉你：绝大部分情况都不是的。大部分的人缘问题都是因为情商。
你的描述也有一些前后矛盾的地方，比如前半部分写长相“大家都忙着找机会和美女帅哥聊天,没空和你聊. 比如有问题都会请教美女帅哥”，以及后来写项目的“……都是我拿下, 大项目都让我冲锋? 产品和开发有问题都找我?”。

另外程序员普遍的幻觉，就是自己挑了某个项目的大梁，很了不起。这不是自己说了算的，需要一些周边同事的反馈。

“我是团队里学历最低的,不是之一, 是最最低的. 仅我一人是专科.其他最差 985, 浙大研究生都为自己的学历感到自卑. 这么牛逼的团队凭什么让我冲锋呢? 团队转型时候第一个大项目凭什么让我来扛呢? 所以虽然学历低, 但是干活和专业能力是最强.”

除了你还有别人这么觉得吗？至少得有一个人这么反馈，你才能这么认为。

总之，看得出你是一个很想上进的人，但可惜在之前的公司里不是特别“合群”。其中可能有公司的原因，也有可能有你自身的原因。如果还想找家公司的话，建议下一家找个外企看看。